메뉴 건너뛰기

웹에서 하는 R 통계

안녕하세요 교수님 

항상 많은 도움 주셔서 감사하고

 

특히 최근에 나온 autoReg package를 통해 손쉽게 publication ready 상태로 출력하게 해주셔서 정말 

정말 많은 도움 받았습니다. 또한  어려워서 R로 구현하지 못하고 있었던 Grey test도 가능하게 해주셔서 논문 작성에 많은 도움이 될꺼같습니다. 

 

 

 

제가 최근에 관심 있는건 예후 예측 점수 만들기 인데요. 사실 점수 만드는 거 자체는 cox를 이용하여 하였는데요, 

그 이후 이점수로 survival을 예측할때 필요한 값을 어떻게 추출해야하는지 모르겠습니다. 

 

공부해보니... 

The probability of death at time ‘‘t’’ can be estimated by the equation:

(여기서 CLIF-C ACLF 장소에 다른 예측점수를 넣으려고 하는데요) 

 

인데요, 여기에 적용하기 위해서는 

 

28day, 90day, 180day, 365day각각의 cumulated baseline hazard (CI(t) and the score coefficient(베타(t)가 필요하는데요, 

 

이 CI(t)와 베타 (t)를 어떻게 구해야할까요?

 

제가 구글링해서 떠듬떠듬 만든 코드는 다음과 같습니다. 

 

fit1<-coxph(Surv(SUD,Final_Pt)~new_score, data=abc)

fit1

 

#cumulated baseline hazard estimate

sv0<-survfit(fit1,newdata=data.frame(new_score=0))  <- 이게 맞을까요...?;;

summary(sv0)

 

#28-days

s28<-min(summary(sv0)$surv[summary(sv0)$time<=28]) <- 이게 맞을까요...?;;

s28

#baseline hazard maybe for 28-days is 

CL28<-1-s28

CL28

 
## beta for 28-days
fit28<-coxph(Surv(SUD28,Final_Pt28)~new_score, data=abc)
B28<-fit28$coefficients
 
 
CL28
B28
...
 
개인적 의견으로는 베타를 구하는 방식은 맞는거같은데요,,, cumulated baseline hazard estimate을 구하는 방법이 정말 저게 맞는지 궁금합니다..;
basehaz()이러한 기능도 흔히 쓴다고 하는데 그럼 각각 28day, 90day, 180day, 365day날짜에 맞는 cumulated baseline hazard estimate는 그결과에서 무엇을 봐야하는걸까요...?
 
항상 많은 도움주셔서 감사하고 
이번에도 미리 감사의 말씀 올립니다. 
 
 
 
 
번호 제목 글쓴이 날짜 조회 수
공지 묻고답하기 게시판을 운영합니다 [1] cardiomoon 2015.04.20 8515
786 Bonferroni's adjustment 관련 문의드립니다. [1] kjptrn 2022.03.23 64
785 x 축 변수가 어려개인 그래프를 그릴 수 있을까요? [1] 나현둥 2022.02.20 88
784 독립변수가 이상한 (?) 경우의 로지스틱 회귀분석 [4] papahong 2022.02.20 78
» 예후예측 점수 만든후 그것으로 survival 예측하는 데에 문제 겪고있습니다. [1] 권혜미 2022.02.08 84
782 기초적인 통계에서 평균, 중간값, 최빈값에 대한 질문입니다. 우엉우왕 2022.02.04 183
781 메타분석 후 plot을 다운로드했을 때 일부 plot이 나오지 않습니다. [1] endostat 2022.01.27 79
780 에러가 났는데 어떻게 해야 하나요? [1] 세렌 2022.01.21 80
779 multipleROC package 질문 [2] 구현아빠 2022.01.13 125
778 교수님, 맥에서 R studio 설치해서 엑셀을 불러오는데 어려움이 있습니다. [1] hslee0511 2022.01.12 96
777 multiple imputation 에 관한 질문 [2] 열공빡공 2022.01.08 104
776 Survival outcome 예측하는 모델 비교 [2] mjsong8705 2022.01.06 199
775 출간오류에 대해 문의드립니다. file 구오 2021.12.27 97
774 안녕하십니까, ROC curve AUC값 비교 (single predictors, regression models)에 대해서 여쭙습니다. [2] kjg 2021.12.25 139
773 ggplot2에서 p값구하기문의 [2] MCB 2021.12.14 357
772 기초적인 질문이지만 .. 여쭤봅니다. [2] 나현둥 2021.12.13 92
771 통계와 관련한 기초적인 질문 드립니다.. [2] 감사합니다 2021.12.10 16580
770 메타분석 해석 문의 [2] 루아로 2021.12.07 188
769 초보라 질문드립니다 ㅜ [2] 쵸쿄쵸쿄 2021.12.06 109
768 ㅠㅠㅠ 초보 질문입니다 [1] 만고 2021.11.26 1677
767 moonBook ANOVA 질문드립니다. [1] 타쿠 2021.11.20 93