메뉴 건너뛰기

웹에서 하는 R 통계

AUPRC 95% CI 구하는 방법

2021.08.08 00:14

sungmas 조회 수:65

다음과 같이 입력하여 AUPRC 값을 산출했습니다. 여기서 95% CI 을 알고 싶은데, 어떻게 해야 할지요, 

이리저리 검색을 해봐도 안나오는데 혹시 아래 패키지론 방법이 없을지,,

만약 안된다면 다른 패키지라도 말씀주시면 정말 감사합니다.

 

amc_s가 prediction 값이고

type_s는 0, 1 (1이 positive) 을 갖는 label입니다.

 

꼭 부탁드립니다 ㅠㅠ

 

 

#AUPRC

 

library(PRROC)

library(ROCR)

library(readxl)

 

f=read_excel(path="C:/Users/Meejeong/Desktop/f.xlsx",sheet=1,col_names=TRUE)

scores=data.frame(f$amc_s,f$type_s)

pr1=pr.curve(scores.class0=scores[scores$f.type_s=="1",]$f.amc_s,

             scores.class1=scores[scores$f.type_s=="0",]$f.amc_s,

             curve=T)

pr1

 

________________________________________________________________________

> pr1

 

  Precision-recall curve

 

    Area under curve (Integral):

     0.7826787 

 

    Area under curve (Davis & Goadrich):

     0.7826927 

 

    Curve for scores from  0  to  0.998 

    ( can be plotted with plot(x) )

번호 제목 글쓴이 날짜 조회 수
공지 묻고답하기 게시판을 운영합니다 [1] cardiomoon 2015.04.20 2534
743 multiple imputation 에 대해 질문이 있습니다 [1] 열공빡공 2021.08.18 53
742 안녕하세요. 교수님 문의드립니다.! [1] 래유니 2021.08.11 42
» AUPRC 95% CI 구하는 방법 [3] sungmas 2021.08.08 65
740 Web-R에서 partial correlation 에 대해서 문의사항 있습니다. [1] 케로스 2021.08.04 40
739 mytable(), mytable2()관련 질문이 드립니다. [1] file 닉네임은별명 2021.08.03 58
738 ROC curve 질문드립니다 [1] file sungmas 2021.07.30 67
737 어떤 통계기법으로 분석하는지 궁금합니다. (사진첨부) [1] file WTFU 2021.07.28 64
736 psm 매칭 방법 및 SMD 관련하여 질문드립니다. [1] aaiek 2021.07.26 58
735 mycph 함수를 사용할 때 Error in .subset2(x, i, exact = exact) : no such index at level 1 라는 에러가 자꾸 뜹니다. [3] dejavu730 2021.07.01 84
734 생존 분석에서 X 축의 Data 가 보이지를 않습니다. [1] 검은새 2021.06.24 62
733 'surPlot' 이 어느 패키지에 있는 함수입니까 교수님? [1] 스튜던트 2021.06.21 76
732 성향점수분석 워크샵 내용 관련 질문드립니다. [2] swpapa 2021.06.09 96
731 치료 전후의 크기비교.. 항상감사드립니다. [4] 라이즈 2021.06.09 90
730 웹R을 이용한 통계분석 책 [1] 야스오 2021.06.01 126
729 multipleROC에 대해 문의드리고 싶습니다. EvelynChae 2021.05.31 80
728 ztable에서 viewer에 표가 뜨지 않는 문제 [3] 1420 2021.05.25 89
727 메타분석의 변수지정 [1] 야스오 2021.05.24 2729
726 Wilcoxon test 정확한 p 값을 계산할 수 없습니다. 버블 2021.05.15 182
725 R code excuetion 에 대해 질문드립니다. [5] 뽀오또 2021.05.13 93
724 PSM 관련하여 기초 질문 드립니다 ㅠ [4] 곰곰11 2021.05.07 117