안녕하세요 선생님.
web-r을 잘 쓰던 와중에 몇가지가 막혀서 여쭤봅니다.
1. 생존분석을 사용하는데, 사이트에서 download as ppt를 하려면
ERROR: 'arg' must be NULL or a character vector
라면서 에러가 뜹니다 (정회원 서버 및 R 3.1 Tokyo 서버 모두)
가끔 통계 값이 많은 것이 있는 경우 피피티로 다운이 되지 않은 적이 몇번이 있었는데,
혹시 해결할 수 있는 방법이 있을지 여쭤봅니다.
2. 또한 선생님께서 쓰신 R 통계와 그래프를 보면,
생존분석을 할 때 0 또는 1로 지정해준 열로 HR를 계산하면 무한대로 나오기 때문에 mycph 함수 내에서 제거하였다.(p.374)
라고 기술 되어 있는데,
cox 모형을 적용할 때, 예를들어 mutation이 있는 군 vs 없는 군, age가 61세 미만 vs 61 이상 군 이렇게 나눠서
모형 분석을 하는 것은 옳지 않은지요? 저렇게 나누게되면 0,1로 코딩하는것과 같다고 생각하기 때문입니다.
( 실제로 변수를 어떤 것을 넣느냐에 따라 무한대로 나오기도하고 나오지 않기도 하였습니다. )
감사합니다.
Comment 2
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cardiomoon
2018.05.03 12:44
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아라리
2018.05.03 14:08
1. 워드로 다운이 받는 tab이 없습니다. html도 fail로 뜨거나 다운 받는 경우 아무내용도 출력되지 않습니다. 선생님께서 말씀해주셔서 결과를 워드에 복사해서 출력을 해보았습니다. 혹시 서버중에 메모리가 더 나은게 있을까요?
2. K-M 에 특정 나이를 기준으로 생존률 차이가 나게 나왔는데, 이경우도 별로 상관이 없을지 여쭤보고 싶습니다.
또한 mutation이 있는 군이 총 46명정도 되는데 mutation positive 명수가 2명이어도 cox analysis에서 왜곡이 없는지 여쭤보고 싶습니다 ( 특정 mutation positive ( n=2) 이 multivariate analysis에서 상당히 큰 effect를 가지고 있었기 때문입니다. )
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안녕하세요? 문건웅입니다.
1. 아마 서버의 메모리 문제인것 같습니다. 혹시 ppt말고 워드로도 다운로드되지 않나요? 서버의 메모리를 충분히 늘려야 하는데 비용 문제 때문에...
현재 웹R의 모든 코드를 업데이트하고 있는데 아직 완성하지 못하였습니다. 곧 해결하겠습니다.
2. mutation이 없는 군, 있는 군을 나누어서 하는 것은 문제가 없을 것 같습니다. 그리고 나이의 경우 굳이 연속형 변수를 두군으로 나누어 할 이유가 있을까요?
감사합니다.