* 교수님, 아래와 같이 model을 만들어 보았을때, 207개의 AchRAbtiter의 자료 중에 7개의 자료가 missing value가 있어서 variable이 0과1로 두개로 나누어지는 거 같습니다. 그래서 web-R의 결과와 똑같이 R console에서 구현이 안되는데요...
coxph는 na.rm=T와 같은 추가할 수 있는 항목이 없는지요?? Web-R의 결과를 R에서 구현해보고자 합니다.
* web-R에서는 다름과 같이 표현되었습니다.
For stepwise backward elimination, data containing NA value were removed. Total nrow: 207-> After na.omit : nrow: 200 Total 7 row(s) were removed.
> cox2=coxph(Surv(MMfreeSurvival,MM==1)~AchRAbTiter_6.7_or_more,method="breslow")
> summary(cox2)
Call: coxph(formula = Surv(MMfreeSurvival, MM == 1) ~ AchRAbTiter_6.7_or_more, method = "breslow")
n= 207, number of events= 134
coef exp(coef) se(coef) z Pr(>|z|)
AchRAbTiter_6.7_or_more0 0.66269 1.94001 0.52583 1.260 0.208
AchRAbTiter_6.7_or_more1 0.09358 1.09810 0.51150 0.183 0.855
exp(coef) exp(-coef) lower .95 upper .95
AchRAbTiter_6.7_or_more0 1.940 0.5155 0.6922 5.437
AchRAbTiter_6.7_or_more1 1.098 0.9107 0.4029 2.993
Concordance= 0.555 (se = 0.02 )
Rsquare= 0.039 (max possible= 0.998 )
Likelihood ratio test= 8.28 on 2 df, p=0.01596
Wald test = 9.01 on 2 df, p=0.01105
Score (logrank) test = 9.26 on 2 df, p=0.009772
Comment 2
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PipeDragoN
2017.01.18 16:51
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cardiomoon
2017.01.18 23:06
혼자 해결하셨다니 다행입니다. 축하드립니다.^^
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아..해결하였습니다. read.xlsx로 읽으니 공란이 NA처리가 안되어서 공란을 NA로 바꾸어준후 read.csv로 읽으니 NA처리가 되어 R console에서도 web-R과 같이 결과가 구현이 되었습니다.